При кратковременном приеме высоких доз 5-HTP побочные эффекты проявляются в виде: тошноты, рвота, желудочных спазмах, понижении либидо (т.к. Серотонин имеет тормозящий эффект в сексуальном поведении), беспокойный сон, а так же возможно продление времени полового акта засчет задержки эякуляции. Стоит так же отметить, что у людей, принимающих 5-HTP длительное время, может развиться толерантность к данному препарату. При длительном приеме побочные эффекты до конца не исследованы. По подтвержденной информации о 5-HTP, будет правильным не принимать препарат на протяжении всего срока беременности и за несколько месяцев до нее. Так же не стоит использовать препарат при шизофрении.