Эстрогены и прогестагены широко применяются в клинике. Лечебное действие этих препаратов во многом определяется их физиологической ролью. Чаще всего их используют для заместительной гормональной терапии в постменопаузе и для гормональной контрацепции, хотя применяемые препараты и дозы в обоих случаях существенно различаются. Пероральные контрацептивы применяют в первую очередь для предупреждения беременности, но они оказывают и другие благоприятные эффекты. Существуют природные и полусинтетические [[Эстрогенные препараты - применение|препараты эстрогенов]], назначаемые внутрь и парентерально.

Многие природные и синтетические соединения, присутствующие в окружающей среде, имитируют, блокируют или модулируют действие эстрогенов в экспериментальных системах. Влияние этих факторов окружающей среды на человека пока не установлено, но этот вопрос активно изучается.