Во время клинических испытаний было зафиксировано несколько малоопасных побочных эффектов:

* импотенция и снижение [[либидо]], что связано со снижением уровня дигидротестостерона<ref>Kristi Monson, PharmD; Arthur Schoenstadt, MD (February 2008). "Beta-Sitosterol Side Effects"</ref>

* в редких случаях возможно развитие ситостеролемии - заболевание, при котором усвоение ситостерина повышено, что приводит к закупорке сосудов сердца и отложению ситостерола в тканях