Основная часть дегидратации эндогенного лептина происходит в почках. '''Величина экскреции гормона почками не зависит от концентрации лептина в крови, артериального давления, наличия или отсутствия стеноза почечной артерии. ''' Гормон в моче не обнаруживался вообще или определялся в следовых количествах, что позволило высказать предположение о внутриканальцевых превращениях лептина. У людей с хроническим заболеванием почек отмечается повышение уровня гормона. Так же участвует в формировании морфологических изменений с формированием гломерулосклероза у людей страдающих ожирением <ref>Подзолков В. И., Брагина А. Е., Родионова Ю. Н. ГЕНДЕРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ МИКРОАЛЬБУМИНУРИИ И ЕЕ ВЗАИМОСВЯЗЬ С ПОКАЗАТЕЛЯМИ ВНУТРИПОЧЕЧНОЙ ГЕМОДИНАМИКИ И УРОВНЕМ ЛЕПТИНА У БОЛЬНЫХ АРТЕРИАЛЬНОЙ ГИПЕРТЕНЗИЕЙ //Рациональная фармакотерапия в кардиологии. – 2012. – Т. 8. – №. 1.</ref>.

Лептин стимулирует пролиферацию эндотелиальных клеток клубочков и экспрессию TGF-pтрансформирующего фактора роста, который в свою очередь активирует механизмы, участвующие в продуцировании внеклеточного матрикса, а именно коллагена [[коллаген]]а типа IV. Увеличение отложения коллагена и повреждение эндотелиальных клеток может в конечном счете привести к гломерулосклерозу, протеинурии и к ХПН хронической почечной недостаточности<ref>Сагинова Е. А. и др. Формирование поражения почек у больных ожирением //Терапевтический архив. – 2006. – Т. 78. – №. 5. – С. 36-41</ref>.