Как и любая другая форма тестостерона, Сустанон конвертируется в [[эстрогены]]. По этой причине Сустанон вызывает такие побочные эффекты как гинекомастия, отеки, отложение жира по женскому типу и угнетение выработки собственного тестостерона. Эти побочные эффекты можно предотвратить, если применять антиэстрогены - , предпочтительнее [[Нолвадекс или Кломид]]. Но так как эти препараты снижают эффективность курса, то лучше применять ингибиторы ароматазы - [[анастрозол]]. Селективные модуляторы эстрогеновых рецепторов (тамоксифен и др.) подключают только во время послекурсовой терапии.